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Diff RNA DNA Alignment Expression Variation Enrichment Assembly Cluster Filter QC KEGG GO Pathway GATK SNP Indel RSEM Bowtie Bowtie2 Hisat2 rMATS Alternative splice NOISeq SOAPnuke Trinity Transcriptome StringTie kallisto kallisto target cis trans rRNA
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蛋白质网络分析

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基因帮
2017-07-26

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权重共表达网络分析

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基因帮
2017-07-26

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Wilcoxon秩和检验与符号秩检验分析

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Wilcoxon秩和检验与符号秩检验分析用于比较两组或多组（若为多组则两两比对）中基因或物种的丰度或者其他指标在组间是否具有显著的统计学差异（P<0.05）。进行此项分析是要求分组至少2个，且每组样本...

基因帮
2017-07-27

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排序分析

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Ordination模块集成了PCA、PCoA、NMDS、MRPP、ANOSIM、PERMNOVA和PERMDISP共7种分析方法；其中PCA、PCoA和NMDS要求样本数量至少大于3个，可以没有分组...

基因帮
2017-07-27

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LEfSe分析

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基因帮
2017-07-28

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环境关联分析

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环境关联分析模块集成了多个分析项目，包括VIF方差膨胀因子分析、RDA/CCA分析、环境因子与排序结果回归分析以及环境因子与优势物种/基因的Spearman相关分析。

基因帮
2017-08-04

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物种和功能组成分析

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该模块集成了两个功能： 1. 利用UpSetR展示样本共有和特有物种/功能基因/代谢通路 2. 绘制丰度值在所有样本中总和排在前30的物种/功能基因/代谢通路热图

基因帮
2017-08-11

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单样品宏基因组报告

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基因帮
2017-08-11

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多样品宏基因组报告

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基因帮
2017-08-16

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重测序CNV

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基因帮
2017-09-08

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群体主成分分析

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基因帮
2017-09-11

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群体结构分析

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基因帮
2017-09-11