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Diff RNA DNA Alignment Expression Variation Enrichment Assembly Cluster Filter QC KEGG GO Pathway GATK SNP Indel RSEM Bowtie Bowtie2 Hisat2 rMATS Alternative splice NOISeq SOAPnuke Trinity Transcriptome StringTie kallisto kallisto target cis trans rRNA
m

bwa_alignment

Alignment

基因帮
2017-02-13

m

snp_indel_pseudo

无标签

使用拼接的假染色体进行SNP，Indel检测，最终还原到原始参考序列的坐标。

基因帮
2017-02-13

m

exome_filter

无标签

一个样品多个lane的fastq文件过滤，使用SOAPnuke。

基因帮
2017-02-17

m

bwa_mem_alignment

无标签

基因帮
2017-02-20

m

callGVCF_GATK

GATK

基因帮
2017-02-27

m

snp_GATK

无标签

基因帮
2017-02-27

m

callGVCF_VARSCAN

无标签

基因帮
2017-02-27

m

indel_GATK

无标签

基因帮
2017-02-27

m

snp_VARSCAN

无标签

基因帮
2017-02-27

m

indel_VARSCAN

无标签

基因帮
2017-02-27

m

gene_fusion

无标签

基因帮
2017-03-22

m

lncRNA_identify

无标签

新的lncRNA鉴定分析。

基因帮
2017-01-11